上海锐翌生物科技有限公司

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测序平台

       公司使用新一代高通量测序仪Illumina HiSeq 4000、Illumina HiSeq 2500、Illumina Miseq、Illumina MiniSeq、Pacbio Sequel 等。为科研技术服务、医学基因诊断、农业分子育种等提供了必要的通量基础。

»Illumina HiSeq 4000

     基于成熟的HiSeq 2500系统,凭借创新的图案化流动槽技术,HiSeq 3000/4000系统带来了无可匹敌的速度和性能。双流动槽的HiSeq4000系统提供了最高的通量和每个样品的最低价格,适合广泛的应用。

为超高通量而设计,HiSeq 3000/HiSeq 4000 系统的每个流动槽在 3.5 天内可产生> 750 Gb 的数据。双流动槽的HiSeq 4000 系统具有最高的单日测序通量和每个样品的最低价格,适合最广泛的应用。HiSeq 4000 系统每天可产生 > 400 Gb 测序数据,每次运行通量高达 1.5 Tb。这种更强的测序能力意味着可以以更高的测序深度完成更多样品的检测,同时,以更短时间获取更加丰富、更有意义的数据。大型研究项目能够更快完成,且手工操作时间更短,成本更低。HiSeq 3000/HiSeq 4000 系统提供了易于使用、触摸屏操作的仪器控制软件。通过优化的逐步指导,控制软件能指导用户完成测序流程中的每一步,包括实验设置,以及试剂和流动槽的上样。此软件还能实时产生数据质量统计,便于准确的运行监控。

                            

 

»Illumina HiSeq 2500

    Illumina公司于2012年初推出的全新测序系统,这款新一代的测序系统将让研究人员和临床医生能够在大约24小时内完成整个基因组的测序,即“一天的基因组”。HiSeq 2500 充分利用了HiSeq 2000 和 MiSeq™ 平台上不断的技术进步。

 

Hiseq 2500系统特点:

1. 无以伦比的速度和灵活性:两个模式,让研究人员能够在27小时内产生120 Gb,或在标准的HiSeq运行中产生600 Gb。

2. 高质量的数据:系统利用久经考验的边合成边测序(SBS)原理,这种原理让HiSeq 2000和MiSeq系统成为最准确的新一代测序仪。
3. 不断扩展的应用:让研究人员能够在一天内测序一个人类基因组或20个外显子组,或在5小时内测序30个RNA样品。行业领先的简约和易用:一体化的簇生成过程实现了与MiSeq平台相似的简化流程。

»Illumina MiSeq

    Illumina公司推出的MiSeq是目前唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行能产生超过1 Gb的数据,且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性,这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台,适合广泛的应用。同时Illumina的最新消息,其已被FDA大量采购并即将通过FDA认证,12年10月,MiSeq系统的测序通量已升级至8G左右。升级通过两个方面完成,一个是cluster密度的增大,升级后cluster密度增加至15-17million,而pair-end读取的reads数目将会增加至30-34million;另一方面是通过测序读长而提升通量,测序读长达到2*300bp,同时测序速度也有所提升。目前,Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长,Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些,都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。 

 


»Illumina MiniSeq

  MiniSeq系统是一台小巧而可靠的台式测序仪,它是专为那些需要简单实惠、但功能强大的靶向测序方案的研究人员而设计的它的研发使NGS成为全世界实验室的日常工具成为可能。

MiniSeq系统的特点:

1.触手可及的Illumina测序。极具价格优势,只需要少量样品即可实现经济高效的运行;

2.按键式操作和轻松的数据分析。利用内置数据分析可实现从文库到结果的无人值守方案;

3.高度灵活,可满足各种研究需求。广泛支持各种DNA和RNA测序应用,适用于从单基因到整个通路的研究检测;

4.端对端支持。提供实验设计和数据分析全面支持。

 

» Pacbio Sequel 

 
   采用PacBio的经典技术单分子实时(SMRT,Single Molecule Real-Time Sequencing)测序技术原理进行测序。Pacbio Sequel测序仪将光路检测内置于Cell中,节省仪器空间,使每个Cell上的15万个零模式波导(ZMWs,Zero-Mode Waveguide)(Pacbio RS II) 升级到100万个零模式波导。每个零模式波导都能够包含一个DNA聚合酶及一条不同的DNA样品链,当核酸参入时,光学系统将捕获的信息翻译成ACGT碱基。一旦测序开始,实时数据传送到初步分析流水线,生成相应的碱基类别和质量值。Pacbio Sequel测序仪在Pacbio RS II的基础上进行改良优化,具有Pacbio RS II测序准确度高、读长超长、无GC偏好性等优点的基础上,大幅度提高测序通量,有效降低测序成本,解决基因组的复杂性难题。