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       真核转录组测序是基于HiSeq平台,对真核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA进行测序,既可研究已知基因,亦能发掘新基因,可以全面快速地获得mRNA序列和丰度信息。根据有无参考基因组,真核转录组测序可以分为:有参考转录组、无参考转录组。

 

测序策略

(1)真核有参考转录组测序

 

测序平台:HiSeq4000
测序类型:PE150

文库类型:200bp
推荐数据量:4-10Gb clean date

(2)真核无参考转录组测序

测序平台:HiSeq4000
测序类型:PE150
文库类型:200bp
推荐数据量:8-12Gb clean data

(3)数字基因表达谱升级版

测序平台:HiSeq2500
测序类型:SE50
文库类型:200bp

推荐数据量:6-20M clean reads