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技术简介 技术路线 技术优势 送样要求 案例解析

       16S rDNA是细菌编码16S rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中。该基因序列足够长(包含约50个功能域),且具有高度的保守性和特异性。16s rDNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具。随着数据库的不断完善,应用该技术可以实现对病原菌进行快速、微量、准确、简便地分类鉴定和检测。

       在真核生物rDNA基因中,18S rDNA和28S rDNA基因间隔序列称为(ITS),位于18S和5.8S之间的为ITS1区,位于5.8S和28S之间的为ITS2区。核糖体DNA中的18S、5.8S和28S的基因组序列在大多数生物中趋于保守,在生物种间变化小,而内转录间隔区ITS1和ITS2作为非编码区,承受的选择压力较小,相对变化较大,可用于真菌分类鉴定。


适用范围
1. 医学领域:消化系统疾病(炎症性肠炎)、内分泌系统疾病(肥胖、糖尿病)等;
2. 农业领域:根际微生物、施肥处理的土壤微生物等;
3. 畜牧领域:动物胃、肠道等;
4. 环境领域:土壤、水体、淤泥、雾霾等;
5. 特殊极端环境:矿山、黄石公园等极端环境条件下的微生物。


测序策略
采用Hiseq 2500测序平台,PE250的测序策略。


研究内容