上海锐翌生物科技有限公司

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对外培训

2015暑期微生物信息分析精品班
发布时间:2015-03-09 16:25   点击率:

        应广大客户的强烈要求,锐翌微生物信息基础班即将开班,现正火热报名中!计划招收30名学员,额满为止(以汇款日期为准),赶快报名吧!
【课程简介】结合上机实际操作,全面介绍高通量测序应用到的生物信息学知识,介绍宏基因组学和单菌基因组构建的相关生物信息学内容。请自带笔记本电脑,便于软件安装。
【培训特色】
实 用
理论与上机操作相结合,围绕二代测序数据产出、分析、整理,内容深入浅出,适合对微生物相关方向有一定的研究基础,缺乏生物信息分析经验,急需掌握微生物高通量测序数据分析方法的科研工作者。
全 面

内容包含了微生物高通量测序数据分析的所有基本方法,涵盖了从方案设计到文章写作的全部流程,还可以通过报名表给我们提建议。

 

开课时间

内   容

7月27日

第1天

上午

基本介绍

1.       高通量测序技术在生命科学领域的广泛应用

2.       肠道微生物与宏基因组学介绍

3.       电脑调试以及各类软件包安装

下午

Linux命令上机操作

1.       登录界面

2.       常用命令操作(基本命令和高级命令初步)

3.       权限控制

4.       Vim编辑器

第2天

上午

Perl语言入门

1.       Perl语言简介和特征

2.       Perl语言的变量、数组、哈希

3.       条件与循环

4.       函数

5.       上机操作

下午

Perl语言入门

1.       Perl字符串处理、正则表达式

2.       文件IO操作

3.       调用系统命令

4.       Perl脚本结构和案例

5.       上机操作

第3天

上午

Python语言入门

1.       Puthon语言简介与特征

2.       Python的数据类型

3.       生物信息常用包

4.       Biopython的基本处理

5.       上机操作

下午

R语言和科学作图入门

1.       R编辑器:Rstudio

2.       常用变量

3.       函数的应用,参数的了解以及自己编写的函数

4.       R数据处理

5.       模块的安装

6.       各种图形展示

第4天

上午

16S和宏基因组分析

1.       16S简介,测序原理及方案

2.       Qiime 16S分析流程

3.       16S分析结果解析

4.       16S案例解析

5.       宏基因组分析流程初探

下午

单菌基因组分析

1.       基因组组装(组装原理、参数选择、组装结果评价)

2.       功能原件预测(编码序列、tRNA、rRNA)

3.       基因功能注释(基于blast比对,用NR、swissprot、KEGG、COG、GO数据库对基因功能进行注释)

4.       SNP、InDel分析(用SoapSNP、和SoapInDel分别进行SNP和InDel分析)

第5天

 

宏基因组结果解析与方案设计

1.       分析结果解读

2.       经典案例解析

3.       项目设计思路


 

 

【培训对象】需要了解微生物分析内容,希望自己能够独立实现数据挖掘、图表制作和文章撰写的科研工作者。

【收费标准】本次培训班为期5天(7.27日-7.31日),注册费用为3500元/人,包含学费和资料费。可协助安排住宿,住宿费自理。

 

【付款方式】现金、支票、转账汇款。

账户信息
名  称:上海锐翌生物科技有限公司
开户行:华夏银行上海外滩支行
帐  号:10554000000101875

 

转账汇款请注明“微生物信息培训班+姓名”

【优惠政策】所有学员自动升级为对外培训VIP会员,终身享受锐翌各类生物信息培训班九折优惠;团报五人以上赠送一个免费名额。

【培训地点】中国•杭州
【报名时间】即日起至7月18日截止(计划招收30名学员,报满为止)
【报名方式】联系当地销售报名,或下载附件中报名表,填写后发送到training@realbio.cn。收到报名信息和培训费后,我们会在两天内跟您电话确认,随即安排座位。

【报名咨询】Tel:021-51001612  Email:training@realbio.cn